市面上有许多付费和免费的论文查重系统，比如中国知网、维普、万方、PaperTime、PaperPass等，可以根据自身需求和预算选择合适的查重系统。

一般来说，论文撰写好后，将毕业论文初稿以电子文档形式上传至选定的查重系统，确保文件格式正确（通常是Word或PDF格式）。提交后，系统会自动对论文进行检测，它会将论文内容与数据库内的大量文献资料进行比对，包括学术期刊、会议论文、学位论文、网络资源等。

论文查重过程可能需要一些时间，一般几分钟到几小时不等，取决于论文长度和系统繁忙程度。查重结束后，系统会生成一份详细的查重报告。查重报告会显示论文的总体重复率以及各部分的详细情况，标出疑似抄袭或重复的部分，有时还会提供参考来源。

如果重复率过高，那么要进行降重修改。可根据查重报告，对论文中重复的部分进行修改，包括改写语句、调整表达方式、重新组织论述结构，以及修正引用格式，确保符合学术规范。初稿查重后，根据修改情况进行多轮查重，直至论文重复率降至可接受的范围内，确保终稿能够顺利通过学校的正式查重。

在选择查重系统时要注意隐私保护，确认系统安全可靠；同时，理解不同查重系统的检测原理和覆盖范围，尽量选择与学校使用的查重系统相接近的服务，以获得更加准确的预估结果。另外，也应注意遵守版权法规，不要滥用查重系统检测他人作品。