确保引用文献时不会在论文查重时被误判为重复内容，可以遵循以下步骤：

1.正确引用：使用适当的引用格式来标明引文。这包括在文本中正确使用引号（如果直接引用），以及提供正确的参考文献信息，如作者名、出版年份、文章标题、期刊名称、卷号和页码等。

2.使用引用生成工具：利用在线引用生成工具或参考文献管理软件（如Zotero、Mendeley、EndNote等）来创建和格式化引用。这些工具可以帮助你遵循特定的引用风格指南，减少格式错误。

3.避免过度引用：尽量避免大量连续的直接引用。如果需要大量使用某篇文献的内容，可以尝试总结、归纳或改写关键点，并以自己的话来表达。

4.理解和解释：在引用文献时，不仅要展示你理解了引用的内容，还要解释这些引用如何支持你的论点或研究。这样可以将引用内容与你的分析结合起来，减少查重系统的误判。

5.检查引用格式：在提交论文前，仔细检查引用格式是否一致、完整且符合所选的引用风格。不正确的引用格式可能会导致查重系统无法识别引用内容，从而将其误判为重复。

6.使用引言和文献综述：在论文的引言或文献综述部分，清晰地介绍和讨论相关的先前研究。这样可以在早期就表明你对现有文献的理解和引用，有助于查重系统正确识别后续的引用内容。

7.人工审查：在提交论文前，进行人工审查，确保所有引用都得到了正确的标记和格式化。如果可能，可以让导师或同行帮助检查引用的准确性。

通过上述步骤，可以最大限度地减少引用内容被误判为重复的风险，并确保你的论文符合学术诚信的标准。记住，论文查重系统并不完美，因此在论文查重报告出现后，仍需要仔细审查任何标记为重复的引用内容，并采取适当的措施来解决。