在毕业论文写作中，脚注是一个重要的部分，脚注可以用来进一步阐述正文中的观点或概念，帮助读者更好地理解论文内容。而毕业论文中的脚注在查重时是否会被检查，取决于具体的论文查重系统和学校的规定。

毕业论文中的脚注是对论文内容的重要补充和注释，但在查重中也起到了关键的作用。脚注中的引用来源和内容应该严格规范，以确保论文的学术诚信性。在进行查重时，系统通常会将脚注内容也列入比对范围，因此脚注的准确性和规范性十分重要。

在格式上，脚注还需要注意字体、行距、段落、序号、页码和标点符号等细节。例如，字体一般使用中文小五宋体或英文Times New Roman 9号字体，行距为单倍行距，段落顶格写，无首行缩进和左缩进。

通过对论文中脚注的查重情况的分析研究，可以发现，脚注中的引用内容、格式和语法错误都可能导致查重报告中出现相似性较高的结果。因此，在写作过程中，作者需要特别注意脚注部分的内容，确保其与正文内容一致，引用格式规范，避免出现重复、错误或不准确的情况。

总的来说，毕业论文当中的脚注在查重中具有一定的重要性，值得作者在写作过程中重视。只有在脚注内容准确规范的前提下，才能确保论文的学术质量和独立性，避免不必要的查重困扰，提升论文的整体质量和学术水平。