论文查重系统的准确性可能会受到以下因素的影响：首先是数据库的完整性和时效性。如果数据库不全面，很多新的文献没有及时收录，就可能导致漏检一些重复内容，或者对一些较新的研究成果无法准确判断。

其次，查重系统所采用的算法也很关键。不同的算法对相似性的认定标准不同，有的可能过于严格，把一些正常的表述也算作重复，而有的可能又过于宽松，导致一些明显的重复没有检测出来。

论文的格式也会有影响。如果论文格式不规范，比如段落划分混乱、引用标注不清晰等，可能会让查重系统产生误判。

还有语言的多样性。如果论文中使用了多种语言、特殊符号或者一些专业术语的特定表达形式，查重系统可能无法准确识别和处理，从而影响结果。

论文的篇幅长短也可能有关系。较长的论文可能出现重复的概率相对较高，但也不能一概而论，这需要查重系统有较好的分析和判断能力。

此外，查重系统自身的稳定性和可靠性也不容忽视。如果系统在运行过程中出现故障或错误，也会导致检测结果不准确。

最后，不同学科领域的特点也会对结果产生影响。比如某些学科可能有一些共用的概念、方法等，容易被误判为重复，这就需要查重系统能够根据学科特点进行合理的判断和调整。