论文查重系统是当前学术界中广泛应用的一种工具，用于检测论文是否存在抄袭或重复内容。在查重系统中，对论文脚注的判定尤为重要，因为脚注是用来标注引用他人观点或文字的来源，直接影响论文是否符合学术规范。

查重系统通过比对论文中的脚注内容与网络中已有的文献、期刊、专利等信息来进行判断。系统会识别脚注中的文献出处信息，包括作者、标题、期刊名称、出版时间等，并与已有数据库进行对比。如果系统发现某个脚注所引用的文献已经存在于数据库中，那么系统会将该部分标记为已有的引用内容，从而避免重复度检测时将其视为抄袭内容。

在判定论文脚注时，查重系统还会考虑引用格式的规范性。不同的引用格式有其特定的要求，系统会根据这些格式要求来检查论文中的引用是否符合规范。若系统发现脚注引用格式与所选格式不符，可能会提示作者进行修改，以符合学术标准。

除此之外，查重系统还会综合考虑脚注引用内容的数量和质量。系统会分析论文中的引用文献数量是否合理，过多或过少都可能引起系统的警示。同时，系统也会评估文献的权威性和相关性，以判断引用内容是否恰当。如果系统认为引用文献质量不高或不相关，可能会对论文的查重结果产生影响。

综上所述，查重系统对论文脚注的判定是一个综合考量的过程，需要系统准确识别引用文献、检查引用格式、评估引用内容的数量和质量。通过合理的判定，查重系统能够有效检测论文中存在的抄袭或重复内容，保障学术研究的正当性和可信度。