毕业论文查重是指通过查重系统对论文进行检测，以确定是否存在抄袭或剽窃行为。然而，毕业论文查重并非仅仅对全文重复率有要求，还应同时对文中引用部分和参考文献的重复率进行检测。

首先，全文重复率是指论文整体的重复情况，包括自身重复和与他人作品的相似度。这是最基本的查重要求，其目的是确保毕业论文的原创性和独立性。然而，全文重复率并不能完全反映论文的真实情况，因为它无法辨别论文中的引用部分和参考文献。因此，学术论文查重系统也应对文中引用部分和参考文献进行检测，以确认其重复率是否合规。

查重系统的要求还应包括对引用部分的合理性和适当性的判断。文中引用他人观点或数据是合理的，但过多或不恰当的引用同样会被查重系统检测到。因此，毕业论文的查重不仅仅是对抄袭行为的防范，更重要的是对学术规范的遵守和引用规范的合理性进行审查。在写作过程中不仅要重视全文的原创性，还要注意引用和参考文献的使用。在写论文时，要注意对文献的合理引用，并避免引用过多相似的内容，以免影响文章的原创性和独特性。

在实际应用中，毕业论文查重要求全面而严谨，既要检测全文的重复率，又要分析引用部分和参考文献的合规性。通过合理使用查重系统，可以确保毕业论文的学术规范性和研究价值，为学术研究提供有力保障。因此，学术界和学术机构应加强对毕业论文查重系统的应用和监管，以提升学术水平和规范研究行为。