论文查重是学术界常见的一项任务，旨在检测文献中是否存在抄袭或剽窃行为。然而，论文查重的内容是否包括附录部分一直以来都存在争议。

附录是为了补充论文主体部分的内容而添加的，通常包括具体的数据、图表、实验过程等。附录并非论文的核心，而是为了更好地展示论文的完整性和可复制性。因此，从理论上讲，附录不应该作为论文查重的重点，查重应主要关注论文主体部分的核心内容。

而附录部分往往包含一些引用内容，如其他研究的数据或信息。这些引用内容可能在本身就是来自外部文献，并已经通过其他方式进行了查重。因此，将附录作为论文查重的重点显得多余和冗余，无助于真正检测论文主体部分的原创性。

不同的查重软件可能对附录的处理方式存在差异。一些查重软件可能会将附录部分视为论文的一部分进行检测，这主要是基于查重软件的算法和设置。然而，大多数查重软件的优化目标是检测论文主体部分的原创性和与外部文献的相关性，而非附录的复制情况。因此，即使附录被包括在查重范围内，其重要性和权重也较低。

由于不同的查重软件和规则存在差异，查重结果可能会包括一些附录部分的重复内容。因此，在撰写论文时，作者应合理安排附录的内容，并避免在附录部分引用已有的外部文献，以减少论文查重中的干扰因素。