论文查重是学术界普遍采用的一种防止抄袭、保护知识产权的重要措施。论文的附录作为内容的一部分，附录通常包含对研究主体有补充作用的资料，如数据集、计算过程、实验方法及原始结果等。尽管这些内容并不直接影响论文的核心论点，但对研究的完整性和透明性起着不可或缺的作用。

论文查重时，大多数主要的查重工具确实会对附录中的内容进行检查，同时也有一小部分系统选择仅检测主要正文部分。附录的查重不仅关乎学术诚信，也间接影响了研究的可靠性和可重复性。一方面，如果研究数据和方法在附录中进行了不当的引用或剽窃，可能会导致科学研究的误导与错误；另一方面，完整的查重过程可以在一定程度上提升研究的严谨性。在撰写附录时，不仅要确保合规性，还应提高对数据和方法的引用标准。

附录查重应被高度重视，尤其是在对于那些实验性强或者数据密集型的学科中。为了适应现代学术环境对透明性和可验证性的要求，建议研究机构和高等院校在实施查重政策时，明确附录的查重标准，并为研究者提供相应的培训和指导。这将有助于提升整体的学术道德水平，确保研究成果的真实性和可靠性，最终推动科学研究的健康发展。

虽然附录常常被视为论文的附属部分，但在实际查重中，其内容同样需受到关注。面对快速发展的学术环境，确保每一份研究成果的独特性与真实性，是研究人员和学术机构的共同责任。