论文查重是学术界普遍关注的问题，尤其是在撰写论文时，如何确保原创性和避免抄袭已成为重要的研究课题。

现有的查重系统采取的检测方法各有差异，尤其在对参考文献的处理上，部分系统会将其作为独立的部分，单独核查引用的准确性和一致性，而另一些系统则可能会将参考文献纳入总体查重的计算之中。这种差异直接关系到作者在写作中的引用方式和文献的处理，进而影响到整篇论文的查重结果。

在这一背景下，许多人对查重系统如何计算参考文献产生了疑问，尤其是在使用知网、paperTime等查重工具时，是否会将参考文献计入查重率引起了广泛关注。知网通常对参考文献进行独立处理，并不计入总重复率，而paperTime则有可能在特定情况下将引用内容视为重复文本。

作者在引用他人研究成果时，无论是书籍、期刊文章还是网络资源，都应遵循学术规范，确保文献的准确引用，这是维护学术诚信的重要前提。通过对参考文献的合理利用和规范引用，可以有效降低查重率，从而提升论文的原创性。建议学术机构在推广查重工具时，需要明确各系统的特点，帮助作者在写作过程中选择合适的引用格式与策略。

参考文献在论文查重中的处理方式直接影响学术写作的规范性和论文的最终结果。通过对查重系统的理解和合理应用，学术作者能够更好地维护自身的学术声誉，推动科研工作的健康发展。